Vlada Republike Slovačke za prioritete predsjedavanja Vijećem Europske unije za period od 1. srpnja do 31. prosinca 2016. odredila je ekonomski jaku Europu, moderno jedinstveno tržište, održivu politika migracije i azila, te globalno angažiranu Europu.
Istaknuto je da Slovačka preuzima predsjedavanje u trenutku kada se Europska unija nalazi u situaciji bez presedana. Ishod britanskog referenduma podrazumijeva njegovu implementaciju i novu definiciju odnosa između EU-a i Ujedinjenog Kraljevstva, ali i unutrašnju refleksiju Unije koji se sastoji od 27 članova.
Tu su i drugi izazovi, posebno izbjeglička i migracijska kriza, terorističke prijetnje, kao i posljedice financijske i ekonomske krize.
Naglašeno je da kao predsjedavajuća zemlja Slovačka želi biti iskren i nepristran posrednik u ispunjavanju strateških prioriteta EU, kao i da želi doprinijeti rješenjima koja će biti prihvatljiva za sve države članice, a istovremeno korisna za Uniju u cjelini.
Slovačka će raditi na postizanju konkretnih rezultata za građane, za poboljšanje njihovog života, kao i za poboljšanje odnosa Unije kao cjeline i njenih građana. Također će nastojati smanjiti barijere između zemalja članica.
''Ključni značaj za unutrašnju i vanjsku stabilnost EU ima slobodna, poštena i uravnotežena trgovina koja se temelji na reciprocitetu i uzajamnoj koristi. Slovačko predsjedavanje će se svoju pozornost usredotočiti prije svega na bilateralne sporazume o slobodnoj trgovini s trećim zemljama, s naglaskom na pregovore na transatlantskoj relaciji'', priopćeno je između ostalog, iz Veleposlanstva Slovačke u BiH.